Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CAPNS2Q96L46 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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