Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRRIQ1Q96JM4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms