Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAT1

POMGNT2, Protein O-linked-mannose beta-1,4-N-acetylglucosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMGNT2Q8NAT1 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POMGNT2Q8NAT1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.5 ms