Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TMCO5AQ8N6Q1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TMCO5AQ8N6Q1 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TMCO5AQ8N6Q1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TMCO5AQ8N6Q1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TMCO5AQ8N6Q1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TMCO5AQ8N6Q1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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TMCO5AQ8N6Q1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMCO5AQ8N6Q1 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMCO5AQ8N6Q1 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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