Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
GCSAMQ8N6F7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
GCSAMQ8N6F7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms