Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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CLDN19Q8N6F1 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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CLDN19Q8N6F1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CLDN19Q8N6F1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CLDN19Q8N6F1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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CLDN19Q8N6F1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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CLDN19Q8N6F1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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CLDN19Q8N6F1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN19Q8N6F1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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