Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
WDR53Q7Z5U6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms