Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NUP54Q7Z3B4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NUP54Q7Z3B4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms