Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H3F3CQ6NXT2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms