Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRNP1Q6NT89 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms