Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SLX4IPQ5VYV7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms