Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DCAF6Q58WW2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DCAF6Q58WW2 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms