Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PKDCCQ504Y2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms