Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP221Q4G0U5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP221Q4G0U5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP221Q4G0U5 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP221Q4G0U5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP221Q4G0U5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP221Q4G0U5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP221Q4G0U5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP221Q4G0U5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP221Q4G0U5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CFAP221Q4G0U5 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP221Q4G0U5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms