Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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NDUFA9Q16795 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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NDUFA9Q16795 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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NDUFA9Q16795 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NDUFA9Q16795 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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