Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNAPC1Q16533 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNAPC1Q16533 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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