Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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DDB1Q16531 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDB1Q16531 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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DDB1Q16531 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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DDB1Q16531 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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DDB1Q16531 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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