Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms