Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC85BQ15834 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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