Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SKIV2LQ15477 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKIV2LQ15477 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms