Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RUNX3Q13761 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX3Q13761 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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