Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ALCAMQ13740 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ALCAMQ13740 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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