Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTCH1Q13635 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
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