Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CALCOCO2Q13137 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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