Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GRIK3Q13003 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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