Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPRJQ12913 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTPRJQ12913 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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