Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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CHD3Q12873 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHD3Q12873 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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