Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CNTN1Q12860 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
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