Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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KCNMA1Q12791 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KCNMA1Q12791 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KCNMA1Q12791 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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