Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CYP4F3Q08477 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CYP4F3Q08477 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms