Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CACNB2Q08289 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms