Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
POLEQ07864 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
POLEQ07864 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
POLEQ07864 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
POLEQ07864 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLEQ07864 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLEQ07864 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLEQ07864 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLEQ07864 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLEQ07864 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLEQ07864 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLEQ07864 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLEQ07864 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms