Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TNFRSF17Q02223 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms