Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PLCB3Q01970 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms