Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPIBQ01892 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms