Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E2F1Q01094 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms