Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2BQ00403 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF2BQ00403 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms