Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMF1P82094 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMF1P82094 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMF1P82094 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMF1P82094 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMF1P82094 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMF1P82094 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMF1P82094 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMF1P82094 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMF1P82094 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMF1P82094 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMF1P82094 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMF1P82094 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMF1P82094 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMF1P82094 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMF1P82094 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms