Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RPS4XP62701 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RPS4XP62701 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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