Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ERVS71-1P61550 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms