Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK1DP48730 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms