Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GNPDA1P46926 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms