Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RANGAP1P46060 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms