Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPD2P43304 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPD2P43304 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPD2P43304 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPD2P43304 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPD2P43304 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPD2P43304 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPD2P43304 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPD2P43304 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPD2P43304 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GPD2P43304 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GPD2P43304 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPD2P43304 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms