Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTN2P35609 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTN2P35609 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms