Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD12P35452 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms