Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HOXD10P28358 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HOXD10P28358 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms