Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CTLA4P16410 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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