Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFTRP13569 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFTRP13569 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFTRP13569 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFTRP13569 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFTRP13569 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFTRP13569 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFTRP13569 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFTRP13569 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CFTRP13569 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CFTRP13569 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CFTRP13569 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms