Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPLO60437 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PPLO60437 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PPLO60437 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPLO60437 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PPLO60437 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPLO60437 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms